引起隐性流产的原因很多，除受精卵本身的染色体异常外，不少专家将之归因于免疫因素。
不少都市女白领一听说自己遭遇了“隐性流产”，都会感到困惑。不少人向他反映自己营养很好，没吃过药，并查明了没有遗传方面的问题，可她们偏偏忽视了自己的身体在快节奏、大压力的生活和工作方式下已发生的变化。其实，内分泌失调、孕激素不足以及女性在受精卵着床期间，“起落动静太大”都是重要的影响因素。
精子和卵子结合成受精卵之后，在着床期内会四处游走，力图找到一个有利的生存环境扎根成长。但女性体内的孕激素太低、黄体酮不足时，子宫内膜很薄，受精卵就像一颗被撒到盐碱地的种子一样，要么扎不了根，要么扎下去的根很浅，吸收不到养分，很快就停止了发育;即使受精卵扎根留住了，也保不准会遇到“狂风暴雨”，在萌芽状态就被“吹走流掉”了。
对受精卵而言，所谓的“狂风暴雨”是指在其着床期几天内，女性身体受的折腾太大，起落动静有异常。这种异常包括活动量太大、活动时间太长以及活动强度过大。比如，有的女性在此期间曾为赶车急跑过、干过重活或工作强度大和时间太长等等，甚至在不知情的情况下，一次过激的性生活或一次便秘引起的用力加大了腹压，都有可能成为受精卵悄悄溜掉的诱因。
