新生儿患感染性腹泻时是许多病原菌引起的如细菌、病毒及真菌引起，胎儿分娩时通过母亲的阴道，细菌可以通过阴道进入胎儿口内引起感染。污染的奶水、奶头以及喂奶的瓶子等。家中卫生条件很好，但是母亲及护理小孩的阿姨不注意清洁卫生成了带菌者。有些新生儿患了重病，例如新生儿败血症，肺炎等也可以通过血流到达肠道，甚至感冒也能把病毒进入肠道内引起腹泻。不同的细菌和病毒引起的腹泻症状也不一样；轻症的病人表现单纯的胃肠道的症状，拉稀一日5一6次至10余次，同时还出现低烧、食奶差、呕吐、精神弱、轻度腹胀、哭闹、唇干、前囟门凹陷。严重时大便稀水样，可增加达到10-20次／日。还伴有高烧呕吐尿少，嗜睡，家长仔细观察新生儿，出现手足凉，皮肤发花，呼吸深长，口唇樱红色。在换尿布时发现小儿反应差，口鼻周围发绀，唇干，眼窝凹陷，出现这种情况，家长千万不要大意，需要到医院输液抢救。
如果新生儿的大便次数多，黄色，有蛋花汤样，常伴有血丝和粘液，虽然小儿未进食很多奶，但是有腥臭味，排便时哭闹，烦躁不安，这类的腹泻，大多数是一种致病性大肠杆菌引起的，是新生儿时期比较常见的腹泻，需要加用消炎药例如黄连素12毫克每日三次及用消化药和口服补液盐充水份。服4-5天痊愈。
