新生儿可以测得抗核抗体阳性，可能发生血小板减少，溶血性贫血或白血病。这些血清学的sle的特征是暂时的，原因在于igg通过胎盘产生阳性的免疫反应。可能由于通过抗体对组织核糖核蛋白的作用造成新生儿心间隔的断裂而发生先天性心脏病。
抗心脂抗体（狼疮抗凝血剂），存在于大约5%~15%的病人中，它与流产，死产和母体栓塞性疾病风险显著增高有关。大剂量的皮质激素（例如泼尼松50mg/d）和小剂量的阿司匹林（80mg/d），可影响血小板血栓素的形成，从而降低了狼疮抗凝血剂的应用。
类风湿性关节炎可以在妊娠时发病；且似乎特别易于在产后发展。它的临床过程一般在妊娠期好转，可能是由于机体对血液循环中游离的可的松水平上升的反应。胎儿不会特别地感染此病，但如果母亲的髋关节和腰椎受累时分娩可能会有困难
重症肌无力在妊娠中有多种过程。频繁发作的肌无力可能需要增高抗胆碱脂酶药物的剂量（如新斯的明）。但要预防出现胆碱能药物过量的症状（例如腹痛，腹泻，呕吐），这时可能需要使用阿托品。对于某些患者，其重症肌无力很难用标准方法治疗，而需要使用可的松和免疫抑制剂控制症状。在分娩时，这些病人可能需要帮助其通气。她们对于镇静药物，止痛药物，má醉药物和硫酸镁都非常敏感。因其igg可以通过胎盘，所以有20%的新生儿可以发生肌无力症，并且，如果母亲没有行胸腺切除术，发生率更高。
